AdEve.5.1
Appendice. Un code génétique de 36 cases

Fig. 20. Dans la strate 3, le code génétique de 36 cases pour les 11 acides aminés essentiels pour l'être humain. Le nombre des codons les codant est 33, en ajoutant les 3 codons ns stop, on trouve, concernant ces acides aminés, un code génétique de 36 codons emplissant exactement la strate 3. L'attribution des cases n'est peut-être pas la meilleure.

Fig. 21c. Dans la strate 3, le code génétique de 36 cases pour les 11 acides aminés essentiels pour l'être humain. Comme la figure précédente mais en couleurs. De plus, on montre deux attributions des cases de la strate 3.

Ces figures sont basées sur la figure 5 montrant le code génétique universel et sur les listes de Imbeau décrites dans le tableau 6X67 ci-après. D'autres auteurs donnent des listes différentes

La redondance moyenne est 3. Si on remplaçait les redondances réelles uniformément par 3, la strate 3 serait remplie par 12 triominos.

Fig. 22c. Dans la strate 3, le code génétique de 36 cases pour les 11 acides aminés essentiels pour l'être humain. Comme les figures précédentes mais dans le code génétique mitochondrial des mammifères. Cette figure est obtenue à partir de la figure 6c.

Ces figures démontrent que, pour les 11 acides aminés choisis par Imbeau et pour la synthèse de protides et de protéines qui ne renfermeraient que ces 11 acides aminés, un code génétique réduit de 64 à 36 cases, prenant place dans la strate 3, suffit, et cela qu'on se base sur le code universel ou sur le code mitochondrial des mammifères.

D'autres choix d'acides aminés, en nombre voisin de 11, se prêteraient aussi bien à une réduction du même genre, par exemple, dans la liste de Imbeau,

Choix de 9 :

remplacer his + gln + lys par sér.

Choix de 10 :

remplacer lys + phé par ala.

Choix de 11 :

remplacer leu par sér,

remplacer lys par cys, asp ou asn.

Choix de 12 :

remplacer leu par ala + cys.

Choix de 13 :

remplacer leu par cys + asp + tyr.

Choix de 14 :

remplacer leu+ thr par cys + asp + asn + glu + tyr.

Etc.

En général, un code génétique restreint à un nombre imposé de 36 cases restera invariant quant au nombre de ses cases sous le passage du code universel au code mitochondrial, s'il renferme les 4 acides aminés Arg, Ile, Mét et Trp. On pourrait en dire autant si le nombre imposé de cases était autre que 36.

Les 4 acides aminés en question sont ceux dont la redondance est affectée lors du passage de l'un à l'autre code.

Je remercie Louis-François Bélanger, étudiant en biologie moléculaire à l'université Laval abj282@agora.ulaval.ca, pour une conversation qui m'a suggéré l'analyse que voilà. Dans cette conversation, il m'a décrit son projet inédit d'un code de 36 cases appliqué aux acides aminés non essentiels.

Voyez sa communication à l'ACFAS 2002. Rôle non essentiel du gène Mek2 dans la signalisation cellulaire lors du développement embryonnaire, de la prolifération cellulaire et de la maturation des thymocytes. BÉLANGER, LOUIS-FRANÇOIS, Université Laval, TREMBLAY, MICHEL, Université Laval, CHARRON, JEAN, Université Laval. http://www.is.mcgill.ca/acfas70/S362.htm

On constate que le nombre 36 est réalisé dans les séquences d'acides aminés de certaines protéines, entre autres des collagènes. Le cas du collagène COL2A1 est présenté dans le tableau qui suitAdEve.5.3.html et les suivants.

La glycine s'y trouve représentée abondamment et on a mis en évidence ses présences, au nombre d'environ 400 sur parmi les 1419 acides aminés présents. Comme le signale Broussais http://www.hbroussais.fr/ U430gp4/221biosynthese.html , elle détermine de très nombreux triplets du type

Gly x y,

où x et y sont des acides aminés autres. La molécule est formée presque entièrement de tels triplets. On rencontre de nombreuses suites ininterrompues de ces triplets, ces suites réalisant le nombre 36 et des nombres plus grands que 36, et cela de 2 manières.

Trente six triplets font une chaîne de 36 fois un triplet.

Douze triplets font une chaîne de 36 acides aminés.

La représentation de ces observations dans le tableau du québécium n'est pas évidente. C'est l'occasion de noter que le système du québécium n'est pas seulement une collection de nombres magiques. C'est une collection de cases douées de relations mutuelles.

La séquence a été tirée de la source suisse http://us.expasy.org/cgi-bin/sprot-ft-details.pl?P02458@SIGNAL@1@25 .

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