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Remarques générales. Dans les figures 156 à 171, la pseudo strate démontre son utilité pour présenter de façon ordonnée les anticodons de tous les tableaux accessibles, qui appartiennent à 5 codes biomoléculaires : cb nomal, cb2, cb4, cb5 et cb12. Les 48 cases de la grille suffisent pour les loger, y compris les doubles emplois. Voyez les figures 124 et 155, les classes O et E d'anticodons.

Classe O. Le plus souvent, remplissage exact des 16 cases du bloc central, parfois, il reste des cases vides. Dans l'un des tableaux, 3 doubles emplois de cette classe occupent en outre 3 cases supplémentaires (H. sapiens).

Classe E. Le nombre de cases employées est fortement variable et va de 6 à 32

Des symétries EO plus ou moins parfaites se manifestent dans la pseudo strate 3, quant à l'occupation des cases et aux multiplicités qui y apparaissent. Voyez par exemple E. coli (Lecomte) et U. urealyticum (figures 156 et 163). Les mitochondries des mammifères et de Limulus se signalent par leur économie d'anticodons : 22 seulement, dont 6 hors bloc central; en retour, chacun de ces anticodons reconnaît en moyenne un nombre relativment élevé de codons.

Statistiques. Voici un relevé des nombres d'anticodons dans la pseudo strate 3, en référence aux figures 156 à 171. Tableau 43. Les nombres d'anticodons inscrits vont de 22 à 48, moyenne 34,4, si l'on excepte les doubles emplois et de 22 à 48, moyenne 35,8, si l'on inclut les doubles emplois.

Sommes et moyennes sans les doubles emplois

Ycompris les doubles emploi

*2 espèces

** 31 espèces. Tableau 44. 31 espèces de mammifères, dont l'être humain, le rhinocéros et le rorqual bleu Balaenoptera musculus, le plus gros animal connu. http://lesbaleines.net/rorqualbleu.htm

http://mamit-trna.u-strasbg.fr/Sequences.html

Ornithorhyncus anatinus

Les anticodons d'Escherichia coli sont au nombre de 36 dans le tableau de Lecomte. Ils entrent exactement dans une strate 3 de 36 cases, et c'est le seul cas d'une strate 3 de 36 cases. (Figures 139, 156). Le total de 36 se répète pour Neisseria meningitis MC58 (TIGR), Chlamydia pneumoniae J138 (Japon), Chlamydia pneumoniae AR39 (TIGR), Chlamydia pneumoniae CML029 (UCB) dans le tableau des anticodons ci-dessous. Tableau 45.

D'après les données disponibles, la strate 3 avec ses 36 cases ordonnées ne constitue évidemment pas une exigence pour les anticodons. Elle paraît cependant représenter une sorte de modèle réalisé approximativement et en moyenne. Voici la liste ordonnée des 16 nombres d'anticodons O et E du Tableau 43. Moyenne 34,4, médiane 34.

22, 22, 28, 29; 30, 31, 32, 32; 36, 37, 38, 39; 40, 45, 45, 45

La diversité de ces nombres semble être une règle. Leur distribution n'évoque nullement une courbe de Gauss mais suggère plutôt une bimodalité avec rassemblement aux valeurs extrêmes 45 et 22. La valeur 22 pourrait apparaître 32 fois au lieu de 2, si l'on comptait chacune des espèces du Tableau 44, formant une distribution aiguille à 22 anticodons.

Nous utilisons les listes d'anticodons de Todd Lowe. Ses listes ne donnent cependant pas les codons reconnus par les anticodons. Par suite, ses résultats ne se prêtent pas commodément à l'inscription dans la grille de la strate 4 et de la pseudo strate 3. Il se prêtent toutefois au dénombrement des anticodons, ce qui est fait ci-dessous. Tableau 45.

http://rna.wustl.edu/GtRDB/

D'après TD. Mise en ordre numérique.

Acides aminés normaux (+ présence de Sélénocystéine)

Somme et meyenne 1238/35 = 35,4

Somme et moyenne 520/15 = 41,3

Somme et moyenne 271/6 = 45,2

Somme et moyenne globales 2129/56 = 38,0

Les résultats des dénombrements sont montrés au Tableau 46 et à la Figure 172. Les Eucaryotes ont le plus grand nombre moyen d'anticodons (45,2), puis viennent dans l'ordre les Archaea (41,3) et les Bactéries (35,4). La pseudo strate 3 présente un nombre inférieur (34,4), qui tient surtout à l'inclusion des anticodons mitochondriaux qui sont au nombre de 22 pour les mammifères et pour un invertébré.

Somme et moyenne 551/16 = 34,4

Somme et moyenne 1238/35 = 35,4

Somme et moyenne 520/15 = 41,3

Somme et moyenne 271/6 = 45,2

Somme et moyenne globales 2680/72 = 37,2

Moyenne des valeurs extrêmes (22+48)/2 = 35

Médiane 38

Fig. 172. Vue d'ensemble selon 72 tableaux d'anticodons d'après le Tableau 46.

À suivre. Les anticodons sont des triplets qui n'existent pas isolés ni rangés à la queue leu leu comme les triplets des codons dans la chaîne de l'ARNm. Ils n'ont d'existence que enserrés dans une séquence d'ARNt et d'efficacité qu'engagés dans la masse d'un ribosome. La suite de cette étude demanderait d'examiner les séquences et les ribosomes.

Il y a 36 et 36. Voilà donc une 2e fois que le nombre 36 se trouve associé aux anticodons. Précédemment, nous avons signalé qu'ils occupent les positions 34, 35 et 36 dans la séquence de l'ARNt. Figures 54, 55, 56. QbSyst2e.06.html

Strate 3 de 36 anticodons. Voici un essai de théorie. Une strate 3 de 36 anticodons serait une sorte de modèle anti ou antimodèle, ne devant être réalisé qu'avec un grand écart, selon 2 règles :

La figure 156 peut nous servir d'antimodèle, même si les résultats des Tableaux 43 et 45 ne la confirment pas pour Escherichia coli.

Exemple d'un antimodèle : le centre de gravité d'un tore. Il est à la fois significatif et dépourvu de matière.

Contraste numérique. Répétons-le : le contraste est tout à fait remarquable entre les nombres des codons et des acides aminés normaux, valant constamment 64+0 -0 et 20+0 -0 respectivement, et les nombres des anticodons valant 36+12 -14.

Strate 3p de 48 cases. La pseudo strate 3 de 48 cases ou strate 3p résulte d'une adpatation du système du québécium. Quoiqu'il en soit de son interprétation théorique, elle est un formalisme qui jusqu'ici a permis d'afficher d'une façon originale et pratique les anticodons de tous les codes biomoléculaires rencontrés.

Le formalisme de la strate 3p permet encore de constituer des codes biomoléculaires complets en 4 strates. Dans le Chapitre 4, nous avons répertorié 16 codes biomoléculaires de 3 strates, tenant compte des dérogations au code normal. QbSyst2e.8.html

Les nouveaux codes en 4 strates augmenteront ce répertoire, parce qu'en général un code 3 strate donné est associé à plusieurs sortes de strates 3p, comme le montre le Tableau 43.

Les figures 173 et 174 donnent des aperçus de tels codes biomoléculaires 4 strates.