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Système du Québécium
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Analyse de 16 codes biomoléculaires.
Les codes biomoléculaires des figures précédentes sont analysés selon les dégénérescences reconnues dans les strates 1 et 2 de chacun d'eux. Leur valeurs restent comprises entre 1 et 8. Tableaux 27 à 34.
Ainsi, au Tableau 27, on identifie les cases de ces codes qui ont la valeur 1. Dans le code cb1 (code universel, fig. 61), cette valeur est réalisée 2 fois, pour M et W. Dans le code cb2, elle est absente.... Dans le code cb23, elle est présente 2 fois. L'avant-dernière colonne totalise ligne par ligne, pour chaque code. La dernière colonne concerne les cases correspondantes de la strate 4.
Dans les Tableaux 28 à 34, la dernière colonne diffère de l'avant-dernière par un facteur égal à la dégénérescence.
Occurrence. La présence d'au moins 1 entrée sur la ligne d'un code donné. Ainsi, sur les 16 codes, seulement 3 renferment une valeur de la dégénérescence égale à 5, mais tous les 16 renferment les valeurs 2, 4 et 6.
Le nombre de cases occupées, pour chaque code cb, totalise 20 dans les strates 1 et 2 et 64 dans la strate 4, àl'exception du code cb3, où il n'y en a que 62 parce que 2 cases ne codent pour aucun acide aminé.
Tableau 27. Dégénérescences = 1. 16 codes cb.
cb
............................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...1
.M..W.....................................................................2.....22...1
...............................................................................0.....03...1
...............................................................................0.....04...1
..M..........................................................................1.....15...1
...............................................................................0.....06...1
..M..W....................................................................2....29...1
..K...M.....................................................................2....210..1
..M..W....................................................................2.....212..1
. M..W....................................................................2.....213..1
. .............................................................................0.....014..1
..K..M.....................................................................2.....215..1
..K..M.....................................................................2.....216..1
..M..W....................................................................2.....221..1
...............................................................................0....022..1
.M..W.....................................................................2.....223..1
.M..W.....................................................................2.....2Occurrences 11/16
............................................Sommes..21...21Tableau 28. Dégénérescences = 2. 16 codes cb.
cb
............................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...2
..C...D...E...F...H...K...N...Q...Y...............................9....182...2
..C...D...E...F...H....I...K...M..N..Q..W...Y...............12...243...2
..C...D...E...F...H....I...K...L...M..N..Q..W...Y..........13....264...2
..C...D...E...F...H...K..N..Q..W..Y...........................10....205...2
..C...D...E...F...H...I...K..M...N..Q..W..Y.................12....246...2
..C...D...E...F...H..K...N..Y.......................................8....169...2
..C...D...E...F...H...Q..W...Y.....................................8....1610..2
..D...E...F...H..K..N...Q...Y......................................8....1612..2
..C...D..E...F...H...K..N...Q...Y.................................9....1813..2
..C...D...E...F...H..I...K...M..N..Q...W..Y.................12...2414..2
..C...D...E...F...H..Q..W...........................................7....1415..2
..C...D...E...F...H..N..W..Y......................................8....1616..2
..C...D...E...F...H..K..N...Q..Y..................................9...1821..2
..C...D...E...F...H..I...K..M...N..Q...W..Y.................12...2422..2
..C...D...E...F...H..K..N...Q..Y..................................9....1823..2
..C...D...E...F...H..K..N...Q..Y..................................9....18Occurrences 16/16
..........................................Sommes..155...310Tableau 29. Dégénérescences = 3. 16 codes cb.
cb
...........................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...3
..I...........................................................................1.....32...3
...............................................................................0.....03...3
...............................................................................0.....04...3
..I............................................................................1....35...3
...............................................................................0....06...3
...I..........................................................................1.....39...3
...I...N.....................................................................2....610..3
..C...I......................................................................2.....612..3
..I...........................................................................1.....313..3
..............................................................................0.....014..3
..I....N...Y...............................................................3.....915..3
..I....Q....................................................................2.....616..3
..I...........................................................................1.....321..3
..............................................................................0.....022..3
..I...........................................................................1.....323..3
..I...........................................................................1.....3Occurrences 11/16
.............................................Somme..16...48Tableau 30. Dégénérescences = 4. 16 codes cb.
cb
...........................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...4
..A...G...P...T...V.....................................................5...202...4
..A...G...P...R...T....V...............................................6...243...4
..A...G...P...R...V.....................................................5...204...4
..A...G...P...T...V.....................................................5...205...4
..A...G...P...R...T...V................................................6...246...4
..A...G...P...Q..T...V................................................6....249...4
..A...G...P...R..T...V.................................................6....2410..4
..A...G...P...T..V.....................................................5....2012..4
..A...G...P...T..V.....................................................5....2013..4
..A...P...R...T..V.....................................................5....2014..4
..A...G...P...R...T..V................................................6....2415..4
..A...G...P...T..V.....................................................5....2016..4
..A...G...P...T..V.....................................................5....2021..4
..A...G...P...R...T..V................................................6....2422..4
..A...G...P...T..V..................... ............................. ...5....2023..4
..A...G...P...T...V................. ................................ ...5....20Occurrences 16/16 Partout A P V (GT)
...............Somme..86..172Tableau 31. Dégénérescences = 5. 16 codes cb.
cb
............................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...5
...............................................................................0....02...5
...............................................................................0....03...5
...............................................................................0....04...5
...............................................................................0....05...5
...............................................................................0....06...5
...............................................................................0....09...5
...............................................................................0.....010..5
..............................................................................0.....012..5
..L..........................................................................1.....513..5
..............................................................................0.....014..5
..............................................................................0.....015..5
..............................................................................0.....016..5
..............................................................................0.....021..5
..............................................................................0.....022..5
..S..........................................................................1.....523..5
..L..........................................................................1.....5Occurrences 3/16
................................................Somme..3...15Tableau 32. Dégénérescences = 6. 16 codes cb.
cb
............................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...6
..L....R...S...............................................................3...182...6
..L....S....................................................................2...123...6
..S..........................................................................1.....64...6
..L...R....S...............................................................3...185...6
..L...........................................................................1....66...6
..L...R....S................................................................3...189...6
..L...........................................................................1....610..6
..L...R...S................................................................3...1812..6
..R..........................................................................1.....613..6
..G...L...S................................................................3...1814..6
..L..........................................................................1.....615..6
..L...R...S................................................................3...1816..6
..R...S.....................................................................2...1221..6
..L..........................................................................1.....622..6
..R..........................................................................1.....623..6
..R...S.....................................................................2...12Occurrences 16/16 (LSR)
...................................Somme..31...70Tableau 33. Dégénérescences = 7. 16 codes cb
cb
...........................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...7
...............................................................................0....02...7
...............................................................................0....03...7
...............................................................................0....04...7
...............................................................................0....05...7
...............................................................................0....06...7
...............................................................................0....09...7
...............................................................................0....010..7
..............................................................................0....012..7
..S..........................................................................1....713..7
..............................................................................0....014..7
..............................................................................0....015..7
..............................................................................0....016..7
..L..........................................................................1....721..7
..............................................................................0....022..7
..L..........................................................................1....723..7
..............................................................................0....0Occurrences 3/16
..............................................Somme...3...21Tableau 34. Dégénérescences = 8. 16 codes cb
cb
...........................................................Cases str. 1 et 2..Str. 4..Dé
..1....2....3...4....5....6....7....8...9..10...11..12..13..141...8
...............................................................................0....02...8
...............................................................................0....03...8
..T...........................................................................1....84...8
...............................................................................0....05...8
..S...........................................................................1....86...8
...............................................................................0....09...8
..S...........................................................................1....810..8
..............................................................................0....012..8
..............................................................................0....013..8
..............................................................................0....014..8
..S..........................................................................1....815..8
..............................................................................0....016..8
..............................................................................0....021..8
..S..........................................................................1....822..8
..............................................................................0....023..8
..............................................................................0....0Occurrences 4/16
................................................Somme..5...40Résultats de l'analyse des 16 codes bc.
Les codes, tels que décrits dans les Tableaux 27 à 34, se prêtent à un grand nombre d'observations sur leurs symétries dans les strates 4, 2 et 1, touchant les codons et les acides aminés, les redondances et les dégénérescences. Voici sur des dernières. Tableaux 35, 36.
On reconnaît la prédominance des valeurs paires, la présence invariable des occurrences paires pour les dégénérescences paires 2, 4, 6 et leur rareté pour les dégénérescences impaires 5, 7 et 8.
Lorsque les dégénérescences 1 et 3 se manifestent, elles s'accompagnent invariablement. On note que dans tous ces cas, qui sont au nombre de 11, les acides aminés M et I qui y participent ont respectivement les dégénérescences 1 et 3. Dans les autres cas, ils ont l'un et l'autre la dégénérescence 2.
Tableau 35. Dégénérescences dans les 16 codes cb. Dénombrements des cases.
........................
Strates 1 et 2.....................Strate 4Dégé.
....Occurrences..Occupations...........Occupations1
.................11/16...........21.........................212
.................16/16..........155.......................3103
.................11/16...........16.........................484
.................16/16...........86.......................3445
...................3/16...........3..........................156
.................16/16...........31.......................1867
...................3/16............3.........................218
...................5/16............5.........................40Sommes
........................320......................1022Et 2 cases vides dans la strate 4, cb3.
..............2Total global 16*84 = 1324
Tableau 36. Redondances des codons stop dans les 16 codes cb.
Redondance
...N. de codes...N. de cases de la strate 41
..................2...........................22
..................9.........................183
..................3..........................94
..................2..........................85
..................0..........................06
..................0..........................07
..................0..........................08
..................0..........................0Isoleucine et méthionine.
Il faut noter l'affinité mutuelle de ces 2 acides aminés. Leur codage par les codons commençant par AU donne 11 fois 3I et 1M, 5 fois 2I et 2M. L'analyse de cette affinité pourrait aider à comprendre la clé du code biomoléculaire.
Fig. 88. Choix des placements des acides aminés dans les strates 1 et 2. Les dégénérescences sont celles du code universel. Fixe: valable pour tous les 16 codes cb.
Placements dans les strates 1 et 2.
La considération des tableaux relatifs aux 16 codes génétiques a suggéré les placements des acides aminés comme suit. Il y a 9 cases fixes. Figure 88.
Strate 1. 3 ont le plus souvent la dégénérescence 6 ou davantage : LSR; T a une fois la dégénérescence 8.
Strate 2. Colonne de gauche : 4 ont constamment la dégénérescence 2 , DEFH.
Couronne centrale : 3 ont constamment la dégénérescence 4 , APV ; G l'a souvent.
Colonne de droite : les 4 qui ont souvent les dégénérescnces 1 ou 3 , IKWM. I et M symétriquement parce qu'ils s'accompagnent constamment avec 4 pour somme fixe de leurs dégénérescences.
CNQY dans les cases restantes de la couronne extérieure.
Virus et codes biomoléculaires.
Le cas des virus est troublant puisqu'ils n'ont aucune vie autonome. Sont-ils des vivants? Ils sont certes tout à l'opposé des végétaux qui sont autotrophes et vivent sans nécessiter le secours d'autres vivants caractérisés. Ils renferment des protéines et soit de l'ADN ou de l'ARN. Il sont incapables de s'alimenter et de se mutiplier, à moins de parasiter une cellule d'un vivant. Ils peuvent changer la structure de l'ADN de l'hôte et par conséquent les protéines synthétisées.
Fait à remarquer, ils ne changent pas le code biomoléculaire de leur hôte, même s'ils changent son application.
Les codes biomoléculaires répertoriés ci-dessus couvrent donc l'ensemble des vivants y compris les couples formés d'un hôte et du virus le parasitant. Tous ces codes répondent à la grille mathématique du système du québécium.
Système du Québécium
Fin de
Chapitre 4. Applications aux biomolécules. Les codes biomoléculaires.
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